あなたの使っているCD-ROMドライブメーカーのホームページへ行って、
DOS用ドライバをダウンロードしたらどうですか。
（日本のHPになかったらUSAのHPにあるかも）

多分インストーラーがついているはずです。
SETUPとかINSTALLとか打ち込んでやれば自動的にAutexec.batやConfig.sysを
組み込んでくれますよ。

ただしMscdex.exeは自動的に組み込んでくれないから、
その前にWindowsの下のCommandディレクトリからフロッピーの適当な場所
（ルートディレクトリなど）にコピーする作業が必要です。

それから、インストール先はデフォルトだとＣドライブになっているでしょうから、
Ａドライブに変更すればインストールできると思います。

それから、コントロールパネルでつくった起動ディスクは、
フロッピーの容量いっぱいに入ってるから、とりあえず不要なコマンド
（UninstallやEditなど）を削除しないと多分インストールできないでしょう。


運悪くHPにドライバがなかったり、インストーラがなかったら、
例えば、HDDをパーティションで区切って２ドライブにして、
ＤドライブのHDDにCD-ROMのWin95ディレクトリをそっくりコピーしてやれば
ドライバうんぬんなんか関係なしにインストールできちゃうんですけどね。

もっとも、今度はFDISKの知識が必要になってくるから同じか。

でも、こっちのほうが長い目でみればいいかも。
ゲームなんかやオンラインソフトの多くはＤドライブに置いとけば、
Win95の再インストールに関係なくつかえるしね。