Zipはメディアの耐久性が非常に悪いです。
頻繁にアクセスを行わないのなら、かまいませんが。

MOはディスクの耐久性は良いです。
メディアも安いしおすすめです。

CD-Rはメディアが安いのと、少なくともメディアは４，５年は持つことからおすすめです。
4倍速なら書き込みもまあまあ許せる範囲内の速さです。
CD-ROMが付いているマシンならどれでも読めるし。

Tapeは信頼性と容量の二つでおすすめです。
ドライブは非常に高いですが、HDD丸ごとバックアップ可能なところは良いですね。
DATのテープ使うやつがよいかな。

PDは使ったことがありません。


ちなみに僕は、MOとCD-Rを併用しています。