２，マルデューク×→マルドゥック機関　エヴァのパイロット（チルドレン）を選出するところで、人類補完委員会直属の機関であり、ネルフとは別組織とされていた。
が、ネルフそのもだということが、加持さんの内偵によりばれちゃった。
ちなみにシンジのクラス(2-A)は、チルドレン候補を集め、管理するための特別クラスだった。