スーパーディス云々以前に、YE-DATAとTEACがUSB用のFDD規格を提唱しています。
現在の対応フォーマットは720KB、1.25MB、1.44MBです。
　DOS/VのBIOSでは、Phoenixがブート対応のものを開発中ということです。

　ということで、こちらの普及が先になるかもしれません。