私は実際にやってるわけでもないのですが、できるはずです。
ノーマルPentiumなどを積んだ９８でBIOSがMMXに対応していない場合のMMX化の手段として、IDEを殺してSCSIのCD-ROMとHDDに換えて総SCSI化するのはポピュラーな方法だと思います。
MMXの改造ページなどを見れば詳しく書いてあると思います。