あ、２３３買いましたか(^^;)
とりあえず、おめでとうございます。

> １ P2L97ではBIOSでクロックの設定をしますが、
> もし速く設定しすぎて立ちあがらなくなった場合はどうすればいいの
> でしょうか？

P2L97のボード Rev1.05以前のを手に入れられたんですね。（これ以降
はHWジャンパなんです）おめでとうございます。

僕が、無茶苦茶なクロック設定をしたときには、自動的に低クロック動
作になった記憶があります。

＃ＢＩＯＳが適正なクロックと診断したのに、実際には動かなかった場合
＃でも、ＢＩＯＳ画面ぐらいは立ち上がらないものなのでしょうか？

> ２ 裏のパネル（？） キーボードコネクタとかパラレルポート
> とかがついてる部分に合う蓋がない今までのは立て一列
> だったけど今度からは２段型なのであけたままは恐いですし
> どうすれば良いのでしょうか？

２段型のＡＴＸのバックパネルですが、僕は開けっ放しにしてあります(笑)
ＥＮＬＩＧＨＴのＥＮ７２３０というケースなのですが、これには２段型の
バックパネルは用意されていないとのことで仕方なく(^^ゞ

とりあえず、お使いのケースの型番を調べて、販売店に「このケースの２
段型のバックパネルは無いか」と電話されてはいかがでしょうか。