IEVer4.0以降をインストールするときに、
以前のプラグイン関係やタスクバー常駐アプリなどを、
かならず、アンインストールと強制終了しておくことです。
また、IEVer4.0をセットアップ後にWindowsが再起動され、
その時にスタートアップや常駐アプリが実行されると、
きちんとセットアップが完了しません。
私の場合は、Win95をセットアップ後にIEVer4.0を、
インストールしました。この方法が一番問題が、
発生しないようです。