> １：雑誌などでQuantumのFireballシリーズがいいとよく聞くので
> 　　なんのためらいもなく”FBST3240AT”を買おうと思っている
> 　　のですがやっぱりいいんですよね？SeegateやMaxtorよりも。

個人的にはいいと思うけど・・・
メーカー/ブランドは趣味的な面が大きいんで。

> ２：ミドルタワーケース内の３．５インチベイに内蔵しようと思っている
> 　　のですがHDDを購入してそのまま取り付けれるものなのですか？
> 　　ネジとかマウンタとかはHDDについているものなのでしょうか？

ケースにもよります。マウンタは。
通常の自作機用ケースなら必要ないはず。
ネジは・・・どうだろ。
結局あって困るものでもないんで、まとめて買っておくのがいいと思うけど。
（自作用パーツを売ってる店なら、大体200円程度で売ってるんじゃないかな？）

> ３：Ｕ−ＡＴＡを生かすにはBIOSの対応はもちろんのこと専用のボードも　　
> 　　いるのでしょうか？

BIOS、チップセットが対応してるならそれでOk。
対応してなくても専用カードを使えばOk。
つまり、どちらか一つでいいです。

あと、利用しているOS用のバスマスタIDEドライバが必要かな。
専用カードならついているはずだし、U-DMA対応マザーなら、マザーに添付されているかメーカーのWebサイトから持ってこれるんじゃないかと。95の場合、ですが。