> マイクロソフトのサイドワインダーゲームパッドがいくつかの、MS-DOS上の
> ゲームで作動しませんでした。
> サイドワインダーは、MS-DOS上では動かないのですか？
> また、何かいい方法があったら教えてください。

付属のゲーム デバイス プロファイラはインストールしました？
そこから設定できるはずですが、まれに相性の問題で動かない事もあります。