今日改めてＯＳを再インストールしてIE4を導入するときに、「デスクトップのアップデート」をやるか聞いてきました。
今回は「ＮＯ」でやったところアクティブデスクトップが使用できず、タスクバーのアップデート（シェルのアップデート）も行いませんでした。

ですのでこの状態にすればＩＥ３の頃とまったく同じパフォーマンスがでます。
ＩＥ４の起動が速くなった分よいです。

そのとき出てきた説明では、アプリの追加と削除（ＩＥ４）でアップデートの解除もできるそうです。

もしよかったら試して見てください。