> しかし、ケースとマザーボードには相性が有り、
> 相性が悪いと不具合を起こすと聞きましたが、本当でしょうか。
> もし本当でしたら、どの何と言うケースが御勧めでしょうか。

相性っていっても、寸法的に取り付けられないとか、そういうことだと
思いますよ。
それ以外の問題は聞いたことも無いし、常識の範囲ではあり得ないと思います。

それともATX電源関係でなにかあるのか？(^^;)