アプリケーションの99パーセント以上は動きません。しかしながら，ごく一部，PC-88のDiskBASICのBasic命令文だけで構成されたプログラムならPC-98用DiskBASICを用意すれば動きます(MS-DOS版DiskBASICは不可）。
　ただし，以下の制限があります。
・BIOSやマシン語プログラムをコールする命令が含まれるプログラムは使えない
・PC-88とPC-98では持っている画面モードが異なるので，共通しない画面モード設定はエラーになる
・MS-DOSとDiskBASICでは，文字コードの管理が異なる（主に98文字）のでそのままでは使えない（テキストファイルも一部文字化けする）。このため，MS-DOS上で動くDiskBASICでは動かない（これについては太古にコンバータが出ていましたが今は入手不可能）

　まあ，動かないと言って良いでしょうね。