> 漢字を使ってたのが男性だから「漢＝おとこ」なのでは
> なくて、「おとこが使う字」だから「漢字」なのでは・・・？

あれは中国（漢帝国）で使ってた文字だから漢字なのでは？
それよりむしろ

> 「無頼漢」、「悪漢」とか「好漢」の「漢」も、男って意味で
> 使-D

フようによばれる人間が男だったから、そこから派生して
漢＝おとこ　なんじゃないかなぁ？（根拠は、ないです。）

漢の字の原義は知りませんし、「梁山泊の好漢」にも女性がいる
じゃないか、というとそうかもしれないですけど …。