> セストレンを目指して、塔に行くとこなんですけど、
> それまでのＤユニットは全部揃えといた方がいいのでしょうか？
> ちなみに、今もって無いのは６、８、１１、１２です。

無くても大丈夫ですが、前作、前々作をふくめたパンツァーワールドを
より楽しむにはそろえた方がいいでしょう。

> あと、キャラバンで病気の男の子が死んでしまいました。
> （薬は見つけたんですけど手後れでした）
> 助けるとなにかあるのでしょうか？

確か、銃のパーツをもらえます（違ったっけ）

> あと、ゲオルギウスでドラゴンの幼生みたいなのを見つけたんですけど、
> 何か意味があるのですか？

これは、Ｄユニットをすべて集めないと、意味がありません。
（ドラゴン＋Ｄユニット＋幼生）×ゾアの森の遺跡＝ここから先はお楽しみ


答えになってないかもしれませんが、とりあえずということで。