> いつも選手が「二度と一緒にサッカーをしたくない奴がいる」
> と言うのですが、誰と合わないのか分かりません。しまいには
> 自主退団してしまう始末・・・。
> 気の合わない選手を見極める方法はあるのですか？
> 誰か教えて下さい。

１．とにかく統率力の高い選手をキャプテンにすること

２．連携が弱いうちは、一緒に試合に出さない

３．他の不満を極力なくす

これでやってみてください、かなりましになるはず
（でも不満をいいやすい選手はいるみたい、
パラメーターがあるのかな）