> 説明書読んでないので詳しくはわかりませんが、高いにこしたことは無いでしょう（おい！）
>
> 詳しい事は私も知りたいです。誰か知ってたら教えてください。

士気は部隊の攻撃回数（攻撃力）に比例します。（と思う（＾＾；）
士気が低いと数で上回っていても引き分けに持ち込まれることが多いです。
士気を下げにくくするには、
１．なるべく前線（戦闘画面でのこと。マップ上ではないです）で戦わせる（前進コマンドを使う）
２．ＨＰが低い状態にさせない（魔法を何回もくらうと一気に下がります）
３．囲まれないようにする（逆に言えば強い敵でも何回も攻撃して士気を下げれば意外に簡単に倒せます）

海賊は陸上では弱いので、地上におびき出して戦うといいと思います。