たしか、スパロボＦの疑問にお答え！ってページが
サターン専門誌（何だったかなぁ）にあって開発者か誰かが
この疑問の答えてましたが、その内容は・・・

シャッフル同盟が出ないのは、彼らは国家間の代理戦争を
しているので、あ〜たら、こ〜たら・・・

とか掲載されてたのを覚えています。
出来れば、容量の関係であって欲しいなぁ・・・
そうすれば、次回などで登場の可能性もあるし。